鄂尔多斯市卫生学校始建于1959年，是自治区唯一一所使用蒙汉两种语言文字授课的卫生职业院校，建校50多年来培养出各类医疗技术人才2万余名，其中2003年开展留学生教育以来，为蒙古国培养蒙医药人才200余名。2009年经自治区人民政府批准成为内蒙古医学院鄂尔多斯分院，2010年开始举办普通专科学历教育，2012年更名为内蒙古医科大学鄂尔多斯学院，实行一校两牌的运行模式。
  学院占地面积333亩，校舍建筑总面积9.93万平方米。现有教职工223名，专任教师194名，其中高级职称教师56名，博士研究生1名，研究生学历教师51名，双师型教师94名。学校现有全日制在校生3404人。学校实践教学条件良好，拥有15600平方米的实验实训中心，设备齐全、仪器先进，能够满足各专业的校内实践教学需求。学校现有直属全科附属医院1所(设床位280张)，有教学医院5所、实习基地55个。
 学校现开设高中起点三年制专科有临床医学、护理、蒙医学、眼视光技术、医药营销、医学检验技术等6个专业；开设的初中起点五年制专科专业有护理、医学影像技术、医学检验技术；初中起点三年制中专有护理、蒙医医疗与蒙药、农村医学、医学影像技术、医学检验技术、药剂、助产等8个专业。